В 1947 году послевоенное время на улице Ларина был открыт Здравпункт, который возглавил выдающийся врач и герой Великой Отечественной Войны Шмулевич Сергей Лазаревич. Под его руководством было отстроено и оснащено здание поликлиники.
В 1949 году переименована в поликлинику №12 Октябрьского района. В 1993 году Поликлиника №12 была зарегистрирована в налоговой службе и получила статус МЛПУЗ - Муниципальное лечебно-профилактическое учреждение здравоохранения «Городская поликлиника №12»
С 2011 года Муниципальное лечебно-профилактическое учреждение здравоохранения «Городская поликлиника №12» (МЛПУЗ «Городская поликлиника №12) переименовано в Муниципальное бюджетное учреждение здравоохранения «Городская поликлиника №12 города Ростова-на-Дону» (МБУЗ «Городская поликлиника №12 г. Ростова-на-Дону»).
В 2016 году МБУЗ «Городская поликлиника №12 города Ростова-на-Дону» реорганизовано путем присоединения к нему МБУЗ «Детская городская поликлиника №6 города Ростова-на-Дону».
В 2023 году МБУЗ «Городская поликлиника №12 города Ростова-на-Дону» переименовали в ГБУ РО «ГП № 12» в г. Ростове-на-Дону
В настоящее время поликлинику возглавляет главный врач Божко Андрей Викторович.